Αποκλειστικός σκοπός της ΕΑΕΑΠ είναι αξιοποίηση και η διαχείριση των ακινήτων επί των οποίων διατηρεί περιουσιακά δικαιώματα ή των οποίων ασκεί τη διοίκηση και διαχείριση η Ιερά Αρχιεπισκοπή Αθηνών ή νομικά πρόσωπα ή φορείς που υπάγονται στη δικαιοδοσία της.
Τα έσοδα της ΕΑΕΑΠ (αντάλλαγμα από αξιοποίηση ακινήτων, τόκοι, μερίσματα κ.λπ.) θα αποδίδονται στο Δημόσιο και την Αρχιεπισκοπή, ενώ προβλέπεται και δυνατότητα διάθεσης των συγκεκριμένων εσόδων της Αρχιεπισκοπής στην ΕΑΕΑΠ.
Η θητεία του Διοικητικού Συμβουλίου θα είναι πενταετής (με δυνατότητα ισόχρονης ανανέωσης), τα μέλη του θα είναι πέντε. Ένα μέλος θα υποδεικνύεται από τον υπουργό Οικονομικών, ένα από τον υπουργό Παιδείας και τρία από την Αρχιεπισκοπή Αθηνών.
Τα ακίνητα θα μεταβιβαστούν στην ΕΑΕΑΠ με σύναψη σχετικής σύμβασης ανάμεσα στην ΕΑΕΑΠ και τον κατά περίπτωση κύριο του ακινήτου, χωρίς αντάλλαγμα και ατελώς, χωρίς την καταβολή οποιουδήποτε φόρου, τέλους ή άλλου βάρους για χρονική περίοδο που δεν μπορεί να υπερβεί τα 99 Jahre.
Επίσης απαλλάσσονται από φόρο, τέλος ή άλλη επιβάρυνση τα έσοδα που αποδίδονται στα πρόσωπα που παραχώρησαν τα δικαιώματα που είχαν επί των ακινήτων.